מעבדה לריצוף גנומי

המעבדה לריצוף גנומי במרכז הרפואי שמיר (אסף הרופא) שותפה במאמץ הלאומי לאיתור וריאנטים של נגיף הקורונה. 

המעבדה היתה הראשונה לזהות את הגעתו של הוריאנט אלפא לישראל וכן את הגעתו של וריאנט למדא. 

צוות המעבדה עובד מסביב לשעון עם הציוד הטכנולוגי הטוב והמתקדם כיום בעולם, ונמצאת בשת"פ הדוק עם משרד הבריאות ופיקוד העורף כחלק המאמץ הלאומי לאיתור וריאנטים חדשים בניסיון למגר את הקורונה. 

במעבדה מבצעים כ-3,000 בדיקות ריצוף ועובדים 24/7 על מנת ולגלות וריאנטים חדשים במידת הצורך.

קורונה 

הליבה של העבודה היום זה עבודה עם נגיף הקורונה, המעבדת אחראית לפחות על 50 אחוז של הריצופים בארץ. אנחנו זיהינו את אלפא וריאנט בריטי, אנחנו הראשונים לזהות את אומיקרון. אנו חוד החנית של משרד הבריאות במאבק בקורונה. כל פעם שיש אירוע מיוחד – אנחנו הראשונים שנכנסים לפעולה. לדוגמא יכולים להתקשר בערב כי ישנה דגימה חשודה
הדגימה נלקחת בשדה התעופה ומגיעה למעבדה אלינו.
נעשו שתי בדיקות PCR ונמצא חשד כי יש וריאנט חדש על ידי כך שנעשה רצוף גנומי מהיר.

מה ריצוף גנומי?

הריצוף הגנומי הוא תהליך שבו משלימים אות אחר אות את הצרוף גנומי של כל אורגניזם – במקרה שלנו הקורונה. הרצף הגנטי הוא זה שמקדד את התכונות של האורגניזם.
במקרה של הקורונה התכונות העיקריות הנבדקות הם: יכולת השכפול, יכולת ההדבקה ועל חומרת המחלה. 

התהליך:
מנוזל הבדיקה מוציאים את הגרעין, עליו עושים את הריצוף – מהמילה צירוף ואז מקבלים פלט מחשב: רצף גנטי של הווירוס.

צוות הביואינפומטיקאים מבצע ניתוח לאפיון הווריאט ומפיץ למשרד בריאות, פיקוד העורף, בריאות הציבור.
אפיון הוריאנט חשוב בקשר לקטיעת שרשרות ההדבקה: כי אם ידוע שזה וריאנט עם תכונת הדבקה גבוהה צריך להחמיר את ההגבלות של האדם.

בדיקות בריצוף:

בדיקות חיוביות של חוזרים מחו"ל, מאושפזים וסקר אוכלוסיה.

כמו כן, המעבדה מרכזת את כל הפעילויות שקשורות לריצוף הגנטי ובדיקות די אגנוסטיות מולקולריות כגון: בודקים פתולוגיות בסרטן, מיקרוביולוגיה בקורונה, גנטיקה טרום הלידה, המטולוגיה אפיון סרטי דם ותמיכה במחקר של חוקרי בית החולים, כל המעטפת תחת קורת גג אחת. 

במקומות אחרים לכל אחד מעבדה יש את הריצוף שלה - ואילו אצלנו כולם עובדים יחד.

רובוטים במעבדה לריצוף גנומי

ישנם במעבדה 3 רובוטים כשהתפקיד שלהם להפיק את החומר הגנטי והכנת הספריה - כל אחד מהם בעלות של מיליון ש"ח. ועוד 3 רובוטים במכשירי ריצוף -  שעלות כל אחד חצי מיליון דולר.

צוות המעבדה

  • מנהל יחידה - ד"ר ניר רעיני.
  • ד״ר יבגני יגרוב.
  • צוות מעבדה רטובה - מבצעים את הבדיקות במעבדה.
  • צוות מעבדה יבשה - מפענחים את הבדיקות.
  • ביואינפורמטיקאים, כימאים, מיקרוביולוגים, מתכנתים, אסטרוביולגוית – חוקרת סביבות חיים מסוכנות, מכירות, ניהול פרויקטים ועוד.
  • עבודה בשילוב גורמי מפתח: פיקוד העורף, משרד הבריאות, הנהלת המרכז הרפואי, המעבדות השונות באגף ותיירות מרפא.

אנחנו בתקשורת

YNET 01.12.21 - הצצה לריצוף הגנטי לזיהוי האומיקרון - לקריאת הכתבה לחצו כאן

ישראל היום 02.12.21 - ביקור במעבדת הריצוף הגנטי - לקריאת הכתבה לחצו כאן